Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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