Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

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Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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Kdm4dQ3U2K5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Kdm4dQ3U2K5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Kdm4dQ3U2K5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Kdm4dQ3U2K5 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Kdm4dQ3U2K5 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Kdm4dQ3U2K5 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Kdm4dQ3U2K5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Kdm4dQ3U2K5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Kdm4dQ3U2K5 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Kdm4dQ3U2K5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kdm4dQ3U2K5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kdm4dQ3U2K5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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