Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms