Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBT3

Tmem173, Stimulator of interferon genes protein, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem173Q3TBT3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Tmem173Q3TBT3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Tmem173Q3TBT3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Tmem173Q3TBT3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Tmem173Q3TBT3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Tmem173Q3TBT3 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem173Q3TBT3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem173Q3TBT3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem173Q3TBT3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem173Q3TBT3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem173Q3TBT3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 269.9 ms