Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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