Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms