Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms