Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnn2Q08093 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms