Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms