Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cntn3Q07409 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Cntn3Q07409 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Cntn3Q07409 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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