Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Msx2Q03358 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msx2Q03358 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms