Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms