Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms