Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SeleQ00690 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SeleQ00690 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms