Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp9bP98195 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms