Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Il20rb-201ENSMUST00000098458 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms