Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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