Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Irx1P81068 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Irx1P81068 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx1P81068 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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