Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx2P81066 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms