Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hoxd13P70217 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hoxd13P70217 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hoxd13P70217 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hoxd13P70217 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hoxd13P70217 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hoxd13P70217 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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