Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SbdsP70122 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbdsP70122 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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