Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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UbdP63072 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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UbdP63072 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UbdP63072 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms