Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp46P62069 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp46P62069 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp46P62069 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp46P62069 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp46P62069 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp46P62069 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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