Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ufm1P61961 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms