Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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