Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Hoxc13P50207 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Hoxc13P50207 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Hoxc13P50207 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Hoxc13P50207 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Hoxc13P50207 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Hoxc13P50207 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Hoxc13P50207 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Hoxc13P50207 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Hoxc13P50207 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Hoxc13P50207 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
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