Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Mmp9P41245 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms