Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TfamP40630 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TfamP40630 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TfamP40630 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
TfamP40630 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms