Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtlP38585 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtlP38585 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtlP38585 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms