Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Plgrkt-208ENSMUST00000143467 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Gm8952-201ENSMUST00000206828 1102 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxa2P31245 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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