Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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