Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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