Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms