Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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PdgfraP26618 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PdgfraP26618 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PdgfraP26618 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PdgfraP26618 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms