Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Ggta1P23336 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Ggta1P23336 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Ggta1P23336 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Ggta1P23336 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Ggta1P23336 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Ggta1P23336 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Ggta1P23336 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ggta1P23336 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ggta1P23336 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ggta1P23336 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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