Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
P20040 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
P20040 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P20040 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P20040 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P20040 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P20040 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P20040 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P20040 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P20040 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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