Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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