Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

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Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprqP0C5E4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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PtprqP0C5E4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprqP0C5E4 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms