Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
LtaP09225 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LtaP09225 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LtaP09225 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LtaP09225 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LtaP09225 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LtaP09225 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LtaP09225 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LtaP09225 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LtaP09225 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LtaP09225 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtaP09225 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtaP09225 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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