Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01789 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01789 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01789 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01789 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01789 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01789 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01789 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01789 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01789 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01789 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01789 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01789 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01789 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01789 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01789 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01789 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01789 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01789 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01789 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01789 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01789 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01789 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01789 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01789 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01789 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01789 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01789 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01789 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01789 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01789 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01789 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01789 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01789 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01789 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms