Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ifnb1P01575 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifnb1P01575 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ifnb1P01575 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ifnb1P01575 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ifnb1P01575 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ifnb1P01575 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifnb1P01575 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms