Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Ccl20O89093 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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Ccl20O89093 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Ccl20O89093 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl20O89093 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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