Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stra6O70491 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Stra6O70491 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Stra6O70491 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Stra6O70491 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Stra6O70491 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Stra6O70491 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Stra6O70491 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stra6O70491 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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