Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Timm44O35857 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms