Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E2f3O35261 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms