Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Degs1O09005 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms