Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dctn1O08788 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dctn1O08788 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dctn1O08788 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dctn1O08788 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn1O08788 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn1O08788 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn1O08788 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms