Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Efna3O08545 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Efna3O08545 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Efna3O08545 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms