Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm379J3QQ19 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm379J3QQ19 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm379J3QQ19 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm379J3QQ19 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm379J3QQ19 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm379J3QQ19 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm379J3QQ19 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm379J3QQ19 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm379J3QQ19 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm379J3QQ19 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm379J3QQ19 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm379J3QQ19 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm379J3QQ19 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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