Protein–RNA interactions for Protein: J3QN86

Gm21882, Predicted gene, 21882, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21882J3QN86 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21882J3QN86 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms